数個前のトピックの質問者です。
自力で無事解決させることができました。

自分や他の人（まぁいないと思いますが）への備忘録として大まかな手順を残していきます。

WinSCPを使い、FTPで繋げる。（メモ:明示的なSSL接続、ボックスに入れる情報は「FTPアカウント設定画面」にアリ）
ｵﾗｽｻﾀ フォルダ以外 をすべて選択し、ダウンロード。（バックアップをとる）

そうしたら、XFREEからログイン直後のHTML,PHP,Wordpressのサーバー選択画面にて、
HTMLの「利用停止」ボタンから利用停止プロセスを進め、データを全消去。
サーバーを作り直す。（私の場合、元あったドメイン名が継承されました）

WinSCPに戻り、最初の手順をやり直す（私の場合、FTPホスト名が変わっていました）
データをアップロードし直し、終了です