やりたいことを下記します。
> ・ツールをルートディレクトリに設置したい。
> ・接続したらリモートサイト側のファイル上記ドメインを開きpublic_htmlから
> 　ディレクトリーを作る。
> ・作成したディレクトリを開いてPC側の展開してあるツール内容をコピーする。
> ・アップロード完了。
> ・webブラウザからhttp://ドメイン名/作成したディレクトリ名/でツールを開く

FileZillaでFTP over　SSLに接続
> ホスト、ユーザー名、パスワード入力、で
> まず、ホストですがftpes://○○○.○○○.jpの○○が判りません
> 通常は　ftpes://example.xsrv.jpのようになるのでしょうが
> ｘdomain無料サーバーではドメインの割り当てというか、は無いのでしょうか。
> 又は、独自ドメインを取得すれば接続できるのでしょうか。
> 尚、ユーザー名、パスワードはどこの画面で見るのでしょうか。
> これも有料契約をすれば取得できるということなのでしょうか。
ツールのマニュアルの一部分を下記します。

上の方にある、「ホスト」、「ユーザー名」、「パスワード」を入力します。エックスサーバーの場合、
FTP over SSLに対応しているので、「ホスト名」には次のように記述します。
ftpes://example.xsrv.jp
「ftpes」がFTP over SSLを表しています。
この例は、エックスサーバーに契約していているドメイン名が「example.xsrv.jp」の場合です。ご
自身のドメイン名に合わせて変更してください。
「ユーザー名」、「パスワード」はそれぞれ、FTP用のものです。これらもご自身のものを入力してく
ださい。
各欄を入力し終えたら、右の「クイック接続」をクリックします。

ログインできると次のように「ディレクトリー一覧の表示成功」とメッセージが表示されます。
右側の「リモートサイト」のパネルがエックスサーバー側です。

インストール先のドメイン名をダブルクリックして開きます。
「public_html」をダブルクリックして開きます。
マウスを右クリックして、一覧の中から「ディレクトリーを作る」を選択し、クリックします。

以上です。　　ツールはブログを複数サイトにメールアド利用（モブログ）配信記事上げするものです。
明確回答くれた方にはお礼として差し上げます。　すてアドくれれば返信します。